كلية العلوم الهندسية جزء من جامعة أم درمان الإسلامية الموجودة حاليا بمنطقة الفتيحاب الواقعة في الجزء الجنوبي من مدينة أم درمان ، وتقع مباني الكلية في جوار الضفة الغربية من النيل الأبيض وتبعد حوالي 10 كيلومترات أعلى النهر من منطقة مقرن النيلين الأزرق والأبيض ويمكن الوصول إليها بسهولة ويسر عبر جسر الإنقاذ بزمن لا يتعدى 10 دقائق من مركز مدينة الخرطوم ، أما مباني الكلية الخاصة بتدريس الطالبات من قسم العمارة والتخطيط فتقع حاليا في مدينة أم درمان - منطقة الثورة

نبعت فكرة إنشاء كلية العلوم الهندسية عام 1988م عندما تفاكر الأستاذ الدكتور دفع الله عبد الله الترابي و الأستاذ الدكتور حامد أحمد الحاج إسماعيل في حاجة البلاد لكلية تدرس العلوم الهندسية وتم إعداد دراسة لذلك وفي أخريات عام 1989م تم الاتصال بالسيد الأستاذ الدكتور مدثر عبد الرحيم مدير جامعة أم درمان الإسلامية آنذاك لتوضيح أهمية انضمام الكلية لتشارك في مسيرة الجامعة وأهدافها السامية التي ترمي للتخريج الهادف الذي يضيف إلى العلوم البعد الديني والأخلاقي

وتم تعيين الأستاذ الدكتور حامد أحمد الحاج إسماعيل أول عميد مؤسس للكلية في مارس 1990م ، واستقبلت الكلية أول دفعة من طلابها في أقسام الهندسة الميكانيكية والكهربائية والمدنية عام 1991م ، وفي عام 1993م استقبلت الكلية الطلبة العائدين من الخارج واستوعبتهم في أقسامها المختلفة وأنشأت قسم العمارة والتخطيط خصيصا لاستيعاب الطلبة العائدين الدارسين للمعمار ، ومع مطلع عام 1999م تم افتتاح قسم هندسة التعدين وتدرس فيها ايضاً العلوم الاساسية وفترة الدراسة للبكالوريوس خمس سنوات كما تمنح درجة الماجستير والدكتوراة في التخصصات المذكورة أعلاه بالاضافة إلى الماجستير في الرياضيات  

توالى على عمادة الكلية السادة:

1/  أ.د. حامد أحمد الحاج إسماعيل - العميد المؤسس

2/  أ.د. جعفر أحمد النوراني - بالإنابة

3/  أ.د. حامد أحمد الحاج إسماعيل

4/  أ.د. عبد المجيد حسن نصر - بالإنابة

5/  د. محمد طالب الله الشيخ

6/  د. الطيب حسن أونسة

7/  د. فتحي محمد سعيد